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METAGENOPOLIS. © INRA, NICOLAS Bertrand

Una revolución, la microbiota en el corazón del bienestar y la salud del ser humano

Explorar los miles de millones de bacterias que habitan nuestra flora intestinal – o microbiota – con fines preventivos y terapéuticos: este es el desafío de MetaGenóPolis (MGP). Oficialmente inaugurado el 2 de julio de 2013, el proyecto MGP es un dispositivo único en Europa, que cuenta con una financiación de 19 millones de euros gracias a las inversiones de futuro. Coordinado y auspiciado por el INRA, MGP reúne al Instituto Hospitalo-Universitario de Cardiometabolismo y Nutrición (ICAN) y a la Universidad Católica de Lyon, y agrupa cuatro innovadoras plataformas al servicio de la comunidad médica, científica e industrial. Estas innovadoras herramientas permitirán sobre todo analizar 7000 muestras al año así como el cribado de 200 000 clones metagenómicos1.

Actualización: 22/06/2017
Publicación: 02/07/2013

Desde el mismo instante de su nacimiento, el hombre es colonizado por un gran número de microorganismos. Tras 24 horas de vida, el intestino de cada individuo contiene ya unos mil millones de bacterias que intervienen en la inmunidad natural, la protección contra patógenos e infecciones o la degradación de los compuestos de la alimentación. Auténtico órgano del cuerpo humano, la microbiota intestinal desempeña un papel primordial en la salud y el bienestar del ser humano.  

MetaGenóPolis: un demostrador preindustrial de biotecnología

Mostrar el impacto de la microbiota intestinal humana en la salud y en las enfermedades no infecciosas, determinar los componentes clave de la interacción entre microflora y células intestinales, fomentar enfoques para modular las poblaciones microbianas, etc. MetaGenóPolis(MGP) pone a disposición de la comunidad académica, médica e industrial unas instalaciones, equipos y conocimientos únicos en Europa que se articulan en torno a cuatro innovadorasplataformas.
 

  • Sambo,cuyo objetivo es la creación de un biobanco nacional formado por más de un millón de muestras intestinales humanas y que pueda hacer frente a la creciente demanda resultante de los ensayos clínicos y de importantes cohortes epidemiológicas y nutricionales.
  • MetaFunes una plataforma de metagenómica funcional que cuenta con un conjunto de tecnologías de cribado de alto rendimiento. Esta herramienta permite identificar las moléculas y los mecanismos del diálogo entre bacterias intestinales y células humanas (bioindicadores, vía terapéutica).
  • MetaQuantes una plataforma de metagenómica cuantitativa: aplica la secuenciación del ADN a alto rendimiento y desarrolla herramientas de bioinformática específicas para la cuantificación de la abundancia relativa de los genes y especies bacterianas de las muestras intestinales humanas. Al comparar los distintos perfiles metagenómicos de varios individuos, los investigadores pueden definir la microbiota intestinal «normal», estudiar las asociaciones entre microbiotas intestinales y enfermedades, y la respuesta a los tratamientos médicos o a la alimentación. Asimismo, pueden proponer un seguimiento temporal del efecto de las intervenciones (bioindicadores o alimentos).
  • Socadetermina el impacto ético y relativo a la sociedad de la investigación en metagenómica humana en el ámbito de la nutrición y de la medicina.

Concretamente, a partir de 2015, MGP permitirá analizar unas 7000 muestras anuales mediante MetaQuant y el cribado de 200 000 clones metagenómicos2 mediante MetaFun. Al mismo tiempo, Sambo podrá albergar unas 10 000 muestras anuales y tratar más de 2000 al año de manera totalmente automatizada.      

 

Aplicaciones concretas en medicina y nutrición

El objetivo de MetaGenóPolis es demostrar que resulta posible proteger, restaurar o trasplantar la microbiota intestinal con fines preventivos o terapéuticos, en el ámbito médico y nutricional. El proyecto MGP permite identificar nuevos bioindicadores de riesgo de enfermedades con el fin de desarrollar herramientas no invasivas que permitan un diagnóstico precoz y un pronóstico de gran precisión; como por ejemplo la detección del riesgo de un síndrome metabólico o de una cirrosis del hígado. Provee igualmente la prueba de los efectos que puedan ejercer sobre el microbioma los distintos tratamientos (como los efectos de un antibiótico u otro) o ciertos alimentos. El objetivo de MGP es por tanto el desarrollo de tratamientos personalizados y recomendaciones nutricionales para la prevención de enfermedades crónicas. Permite considerar nuevas intervenciones modulando la microbiota intestinal (prebióticos, probióticos, alimentos funcionales, etc.). A modo de ejemplo, un régimen de calorías restringidas da como resultado una mejora de los parámetros metabólicos pero también de la composición del microbioma.

Desde su lanzamiento, MGP ha dirigido 8 proyectos junto con sus socios industriales y académicos y, dentro de 3 años, habrá iniciado al menos 15 nuevos proyectos de investigación y desarrollo.      

 

El INRA, líder mundial en el ámbito de la metagenómica humana

Mediante la secuenciación directa del ADN presente en las muestras, la metagenómica trata de estudiar el contenido genético de una muestra procedente de un entorno complejo, como es el intestino. Durante la aparición de esta disciplina, el INRA ha sabido adoptar una posición de líder a nivel internacional, en particular gracias a sus trabajos sobre ecología microbiana. El proyecto MetaGenóPolis ha sido elaborado a partir de los conocimientos adquiridos en proyectos europeos como MetaHIT y Micro-Obese, que han permitido llegar a resultados más significativos (véase recuadro a continuación), entre los cuales:

- la creación de un amplio repertorio de genes de la microbiota intestinal humana;

- el descubrimiento de tres tipos de firmas bacterianas humanas (tres «enterotipos» humanos);

- la caracterización de la microbiota relacionada con dos patologías importantes que son la obesidad y las enfermedades inflamatorias crónicas del intestino;

- el desarrollo a escala piloto de un sistema de cribado de alto rendimiento de metagenómica funcional.     

1 Estos clones metagenómicos muestran grandes fragmentos de genomas procedentes del microbioma intestinal humano.

2 El microbioma es el conjunto del genoma de la microbiota.

Contacto
Contacto científico:

Contacto de prensa:
Servicio de prensa del INRA (+33 (0) 1 42 75 91 86)
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